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Arrêt long en ALD : combien de temps es-tu payé, et combien ?

Une affection de longue durée fait passer ton droit aux indemnités journalières de 360 jours à 3 ans, et les 3 jours de carence ne sont retenus qu'une seule fois sur toute la période. Sur 2 400 € brut par mois, l'indemnité vaut 39,45 € brut par jour, soit 1 104 € net sur un mois une fois la CSG et la CRDS retirées.

Page publiée le . Durée d'indemnisation, régime de carence, plafond et imposition relevés à la source le 19 août 2026 : service-public.gouv.fr, « Arrêt maladie : indemnités journalières versées au salarié », fiche F3053, « Prise en charge d'une affection de longue durée (ALD) par l'Assurance maladie », fiche F34068 et ameli.fr, « Arrêt de travail pour maladie : les indemnités journalières du salarié ». Montants nets dérivés du plafond et des taux de prélèvement du site, jamais recopiés.

3 ans

la durée pendant laquelle l'Assurance maladie verse tes indemnités quand l'arrêt est lié à ton ALD, contre 360 jours sinon. Un nouveau délai de 3 ans s'ouvre après un an de reprise

1 fois

le nombre de fois où les 3 jours de carence te sont retenus sur toute la période de 3 ans. Chaque arrêt suivant lié à la même affection est payé dès le premier jour

42,97 €

le maximum brut par jour, quel que soit ton salaire. Au-delà de 2 613,83 € brut par mois, l'indemnité n'augmente plus : c'est le plafond de 1,4 SMIC

Ce que tu touches vraiment, par jour et par mois

Montants NETS de CSG et de CRDS, c'est-à-dire ce qui arrive sur ton compte. Les prélèvements sociaux retirent 6,7 % de l'indemnité brute que la caisse calcule. En ALD exonérante, aucun impôt sur le revenu ne vient ensuite s'y ajouter.

Ce que tu touches vraiment, par jour et par mois
Ton salaire brut par moisTon indemnité nette par jourSur un mois complet
1 600 €24,54 €736 €
2 000 €30,68 €920 €
2 400 €36,81 €1 104 €
2 613,83 €40,09 €1 203 €
3 200 €40,09 €1 203 €

Au-delà de 2 613,83 € brut par mois, la ligne ne bouge plus : le salaire pris en compte est plafonné à 1,4 fois le SMIC mensuel, ce qui fixe l'indemnité à 42,97 € brut par jour au maximum. Le premier mois d'arrêt est amputé des 3 jours de carence, soit environ 110 € sur 2 400 € brut ; en ALD, tu ne les reperds plus ensuite. Ces montants sont ceux de la Sécurité sociale seule : le complément de ton employeur et de ta convention collective s'y ajoute.

Ce que ton type d'ALD change à tes droits

Toutes les ALD ne donnent pas les mêmes droits, et la différence ne porte pas seulement sur les soins. C'est la reconnaissance en ALD exonérante qui exonère les indemnités d'impôt sur le revenu.

Ce que ton type d'ALD change à tes droits
Ta situationDurée du droit aux indemnitésCarence et impôt
ALD exonérante (le protocole de soins ouvre le 100 %)3 ans, renouvelables après un an de reprisecarence retenue une seule fois sur 3 ans ; indemnités non imposables
ALD non exonérante (soins remboursés aux taux habituels)3 ans si les arrêts sont liés à l'affectioncarence retenue une seule fois sur 3 ans ; indemnités imposables
Arrêt maladie ordinaire, sans ALD360 jours d'indemnités sur une période de 3 anscarence de 3 jours à chaque arrêt ; indemnités imposables

Sur la durée hors ALD, les deux sources publiques ne disent pas tout à fait la même chose : ameli.fr écrit « 360 jours d'indemnités journalières sur une période maximale de 3 ans », service-public.gouv.fr écrit « au maximum 12 mois d'indemnités journalières par période de 3 ans consécutifs ». Ce n'est pas un désaccord de fond mais une simplification d'unité : 12 mois se lit comme 365 jours, quand le compte réglementaire est de 360 jours. L'écart de 5 jours ne concerne qu'une personne, celle qui arrive au bout de son droit hors ALD, et c'est le chiffre de 360 jours qui fait foi. Au-delà du 6e mois d'arrêt, le versement reste soumis à l'accord du médecin conseil, ALD ou non.

Comment on passe de ton salaire à ce montant

Le calcul, étape par étape

trois opérations, et un plafond qui coupe

Le point de départ n'est pas ton salaire mensuel mais ton salaire journalier de base : la moyenne de tes 2 400 € brut sur les 3 derniers mois, divisée par 91,25. Sur cet exemple, cela donne 78,90 € par jour.

L'indemnité journalière vaut la moitié de ce montant, soit 39,45 € brut. C'est la règle que publie l'Assurance maladie, avec son propre exemple : un salaire journalier de 75 € donne une indemnité de 37,50 € brut.

Le plafond intervient ensuite, et il ne porte pas sur l'indemnité mais sur le salaire pris en compte, limité à 1,4 fois le SMIC mensuel. Depuis la revalorisation du SMIC du 1er juin 2026, ce plafond vaut 2 613,83 € brut par mois pour les arrêts prescrits à compter de juillet 2026, ce qui fixe l'indemnité maximale à 42,97 € brut par jour. Un salaire de 3 200 € et un salaire de 5 000 € donnent donc exactement la même indemnité.

Reste le passage au net. La CSG à 6,2 % et la CRDS à 0,5 % sont retirées de l'indemnité brute, soit 6,7 % au total. C'est ce net qui arrive sur ton compte, et c'est lui que le tableau du haut publie. Attention à ne pas le confondre avec la retenue forfaitaire de 21 % : celle-là s'applique aux indemnités de maternité et de paternité, qui sont servies nettes, jamais aux indemnités maladie.

Ton salaire n'est pas dans le tableau

Les cinq lignes ci-dessus servent à situer un ordre de grandeur. Le calculateur applique la même règle à ton salaire exact, carence déduite, et te donne le total sur la durée de ton arrêt.

Ce qui se passe quand les 3 ans sont écoulés

Le droit aux indemnités journalières s'arrête, et il n'existe que deux issues. Soit tu reprends le travail, avec ou sans aménagement de poste. Soit tu es placé en invalidité, avec une pension dont le montant dépend de ta catégorie d'invalidité.

Le passage en invalidité n'attend pas forcément les trois ans : le médecin conseil de l'Assurance maladie peut le décider plus tôt, dès qu'il juge ton état stabilisé, c'est-à-dire quand il n'attend plus d'amélioration. Cette décision ne t'appartient pas et elle change complètement la nature de ton revenu.

Un troisième chemin existe pour reprendre progressivement sans perdre tout revenu : le mi-temps thérapeutique, qui cumule un salaire à temps partiel et une indemnité journalière maintenue. Il se prescrit pendant l'arrêt, pas après.

Aller plus loin

Le complément de ton employeur, et pourquoi il n'est pas sur cette page

il ne dépend pas de ton ALD

Les montants publiés plus haut sont ceux de la Sécurité sociale seule. Ton employeur complète, sous condition d'ancienneté, et ta convention collective peut aller au-delà, parfois jusqu'au maintien intégral du salaire.

Cette règle ne dépend en rien de ton ALD : elle est la même pour un arrêt de trois jours et pour un arrêt de trois ans. Elle a donc sa propre page, qui porte la grille complète par ancienneté : arrêt maladie et salaire, ce que tu touches vraiment. La reproduire ici n'ajouterait rien et ferait deux pages pour une seule réponse.

Le levier le plus fort reste ta convention collective : suppression de la carence, maintien à 100 %, durée d'indemnisation allongée. Sur un arrêt long, l'écart entre deux conventions se compte en milliers d'euros.

Tes trimestres de retraite pendant l'arrêt

60 jours indemnisés valident un trimestre

Un arrêt long ne creuse pas ta carrière autant qu'on le croit. Chaque période de 60 jours indemnisés valide un trimestre, dans la limite de 4 trimestres par an, soit exactement ce qu'une année travaillée rapporte.

Les jours de carence sont comptés dans ce calcul, puisque c'est la durée de l'arrêt qui est prise en compte et non le nombre de jours payés. Conserve tes relevés d'indemnités journalières sans limite de durée, comme tes bulletins de salaire : ce sont eux qui font la preuve.

Les compléments de revenu à réexaminer pendant un arrêt long

la prime d'activité bascule au 4e mois

Les indemnités journalières comptent comme un revenu d'activité pendant les 3 premiers mois de l'arrêt : la prime d'activité se maintient sur cette période, puis le droit s'interrompt le plus souvent au-delà.

La baisse de revenu qui suit peut en revanche ouvrir d'autres droits qu'il vaut la peine de réexaminer à ce moment précis, et non au début de l'arrêt : la complémentaire santé solidaire sur critère de ressources, et, si l'arrêt débouche sur une invalidité durable, les dispositifs recensés sur la page aides au handicap.

Arrêt long et ALD ne sont pas la même chose

une durée contre une reconnaissance

La confusion est répandue jusque sur les pages les mieux classées, et elle mène à des attentes fausses dans les deux sens.

Un arrêt long est une durée, rien de plus. Une ALD est une reconnaissance médicale, demandée par ton médecin traitant et accordée par l'Assurance maladie au vu d'un protocole de soins. On peut être arrêté un an sans ALD, et vivre des années en ALD sans le moindre jour d'arrêt.

Ce qui dépend de la DURÉE : au-delà du 6e mois, le versement des indemnités passe sous l'accord du médecin conseil, et il faut être affilié depuis 12 mois. Ce qui dépend de l'ALD : les 3 ans, la carence retenue une seule fois, et l'exonération d'impôt quand l'ALD est exonérante.

Questions fréquentes sur l'arrêt de travail en ALD

La reconnaissance en ALD ne se demande pas toute seule

C'est ton médecin traitant qui établit le protocole de soins et le transmet au médecin conseil de l'Assurance maladie. Tant que la reconnaissance n'est pas accordée, tes arrêts relèvent du régime ordinaire : 360 jours au lieu de 3 ans, et 3 jours de carence à chaque fois.

Sources

Les montants nets publiés sur cette page ne sont recopiés d'aucune source : ils sont calculés à partir du plafond dérivé du SMIC en vigueur et des taux de prélèvement ci-dessus. La règle de calcul a été vérifiée sur deux valeurs publiées par l'Assurance maladie, son exemple à 37,50 € et son plafond à 42,97 €, qu'elle reproduit l'une et l'autre au centime.