En arrêt maladie, quelle part de ton salaire tu touches ?

Dès le 4e jour d'arrêt, l'Assurance maladie verse des indemnités journalières (IJSS). Elles se calculent sur ton salaire, pas sur un forfait :

IJSS = 50 % du salaire journalier de base

Si tu es payé au mois, le salaire journalier de base est le total de tes 3 derniers salaires bruts divisé par 91,25. Une activité saisonnière se calcule sur 12 mois. Ce salaire est retenu dans la limite de 1,4 fois le SMIC mensuel, soit 2 613,82 € brut par mois au SMIC en vigueur : au-delà, l'indemnité n'augmente plus, et elle plafonne à 42,97 € brut par jour pour un arrêt prescrit à compter de juillet 2026 (41,95 € pour un arrêt prescrit de février à juin 2026, d'après les montants 2026 publiés par service-public.gouv.fr : le plafond suit le SMIC en vigueur le mois qui précède l'arrêt), d'après la fiche d'ameli.fr sur les indemnités journalières du salarié.

• Carence de 3 jours : aucune indemnité pour les 3 premiers jours de chaque arrêt. Elle ne s'applique pas si tu reprends une prolongation moins de 48 heures après la fin de l'arrêt précédent, en cas d'accident du travail ou de maladie professionnelle, après une fausse couche, ni pour une affection de longue durée, où elle n'est retenue qu'une fois par période de 3 ans.
• Droits ouverts si tu as travaillé au moins 150 heures dans les 3 mois qui précèdent l'arrêt, ou cotisé sur au moins 1 015 fois le SMIC horaire dans les 6 mois précédents, soit 12 494,65 € au SMIC en vigueur. Au-delà de 6 mois d'arrêt, il faut 12 mois d'affiliation et 600 heures sur les 12 derniers mois.
• Durée : 360 jours d'indemnités au maximum sur une période de 3 ans, et 3 ans pour une affection de longue durée.
• Versement après traitement du dossier, puis tous les 14 jours en moyenne, directement par ta caisse sauf subrogation (voir plus bas). L'arrêt se transmet à l'employeur et à la caisse dans les 48 heures, et qui envoie quoi dépend de la façon dont ton médecin l'a prescrit.
• Prélèvements : CSG à 6,2 % et CRDS à 0,5 %, sans les cotisations sociales d'un salaire, puis l'impôt sur le revenu par prélèvement à la source (sauf les arrêts liés à une affection de longue durée exonérante).
• Durée des ordonnances depuis le 1er septembre 2026 : un arrêt initial ne peut pas dépasser 31 jours et chaque prolongation 62 jours. Ce plafond borne chaque ordonnance, pas la durée totale de ton arrêt : ton médecin peut prolonger au-delà si ton état le nécessite, et il ne s'applique pas à Mayotte. Ni le montant de l'indemnité ni la carence ne changent (décret n° 2026-498 du 12 juin 2026, article R. 162-1-7-1 du code de la sécurité sociale, annonce de service-public.gouv.fr).

Un arrêt pour épuisement professionnel suit exactement ces règles : ce qu'il change sur ta paie est traité dans le burn-out et ta fiche de paie. Pour le montant exact de la Sécurité sociale sur ton salaire et ta durée d'arrêt, carence déduite, le calculateur d'indemnités journalières applique cette formule.

Prenons un salarié payé 2 100 € brut par mois, avec 8 ans d'ancienneté, en arrêt maladie pendant 30 jours. Son salaire journalier de base vaut 69,04 € (6 300 € de bruts sur 3 mois, divisés par 91,25), donc son indemnité journalière est de 34,52 €, bien sous le plafond de 42,97 €. Sa rémunération brute vaut 70 € par jour calendaire.

• Jours 1 à 3 : rien.
• Jours 4 à 7 : 34,52 € par jour, la Sécurité sociale seule.
• Jours 8 à 30 : 63,00 € par jour, soit 90 % de 70 €, dont 34,52 € de la Sécurité sociale et le reste de l'employeur.

Total : 1 587,08 € brut sur le mois, dont 932,04 € de la Sécurité sociale et 655,04 € de l'employeur, contre 2 100 € en travaillant. En net avant impôt, l'écart est un peu plus petit qu'il n'y paraît, parce que les indemnités ne supportent que la CSG et la CRDS là où un salaire supporte environ 21 % de cotisations : il reste environ 1 388 € net sur 1 662 € habituellement, soit 84 % de ton net. Oui, tu perds de l'argent, et l'essentiel de la perte tient dans la première semaine.

Le même mois sous une convention collective qui supprime les carences et maintient 90 % dès le premier jour rend 1 890 € brut et environ 1 628 € net, soit 98 % de ton net habituel : à ce niveau tu ne perds presque rien. Avec un maintien à 100 %, tu touches ton net habituel, 1 662 €, et pas davantage : la loi plafonne le maintien au net que tu aurais eu en travaillant. L'écart entre ces trois lignes, c'est exactement ce que pèse ta convention collective.

Sans un an d'ancienneté, le même arrêt ne rapporte que les indemnités journalières, 932,04 € brut sur le mois : à peine plus de la moitié du net habituel. Ces montants sont calculés sur un mois de 30 jours calendaires et un salarié non cadre ; ta fiche de paie décompte l'absence selon l'usage de ton entreprise, et l'écart se joue à quelques euros. Ton net habituel se lit dans la différence entre brut et net.